Po smrti velekrále se Skyrim rozdělil na dvě frakce. 

Bouřní hávy - ti, kteří bojují za opětovné přivlastnění provincie pouze nordům. A na legii, kteří bojují za svobodu všeho živoucího a spravedlnost. Při cestě na vaší popravu dokáže uniknout několik vojáků a generálů a právě i Ulfrik Bouřný háv (dominující postava Bouřných hávů). Tím se opět rozpoutala občanská válka.

Mezi tím se na Skyrim snesla ještě větší hrozba - Alduin, bůh všeho zla. Ten se opět vrátil, aby se pomstil drakorozeným, kteří ho před několika stovkami let poslali skrze časový prostor - samozřejmě nevědomě.

Vy, jakožto jediný drakorozený, máte povinnost Alduina jednou provždy zničit a zachránit tak svět před jeho naprostým zničením. V tom vám pomůžou Šedovousí, skupinka lidí, která také dokáže využít sílu dračích pokřiků.